H Εταιρεία Αξιοποίησης και Διαχείρισης της Περιουσίας του Πανεπιστημίου Κρήτης σύμφωνα με το ιδρυτικό καταστατικό της και με τις αντίστοιχες πράξεις της Συγκλήτου, διαχειρίζεται και αξιοποιεί σημαντικό μέρος των κληροδοτημάτων που έχουν περιέλθει στο Πανεπιστήμιο Κρήτης, ενεργώντας ως εντολοδόχος και πληρεξούσιος του Ιδρύματος.
Η Αξιοποίηση και η Διαχείριση των Κληροδοτημάτων ακολουθεί την ισχύουσα νομοθεσία του 1939, Ν. 2039/39 και το Β.Δ. της 30-11-1939, καθώς και διάφορες ερμηνευτικές εγκύκλιους και γνωμοδοτήσεις.
Με το νέο Κώδικα Κοινωφελών Περιουσιών, από τις 10 Νοεμβρίου 2013 τίθεται σε ισχύ ο Ν. 4182/2013, αναμορφώνεται το θεσμικό πλαίσιο και απλουστεύονται οι διαδικασίες διαχείρισης των Κληροδοτημάτων. Ακολουθεί η πρώτη τροποποίηση του με τον Ν.4223/2013, άρθρο 32 καθώς και η υπ΄ αριθ. 1/06-03-2014 ερμηνευτική εγκύκλιος του Υπουργείου Οικονομικών, για την ορθή εφαρμογή του «Κώδικα Κοινωφελών Περιουσιών και Σχολαζουσών Κληρονομιών και λοιπές διατάξεις». Ακολουθεί η δεύτερη τροποποίηση με το άρθρο 171, Ν.4261/2014.
